1959年1月，中共中央召开教育工作会议，总结1958年“教育革命”的成绩和问题。市委、教育部对附中1958年的“教育大革命”中的某些不恰当做法提出批评。

　　1960年施行“中学五年一贯制”，采用师范大学编写的新教材。

　　中宣部长陆定一和中央教育部长杨秀峰来校观察。

　　本年度高考成绩优异，全市12名“状元”学生中，附中占了8名。

　　附中被评为全市、全国文教战线红旗单位。6名教师被评为市级教育战线先进工作者。

　　1961年11月2日，庆祝建校60周年。中央教育部长杨秀峰、副部长林砺儒、市委书记刘导生到校参加庆祝活动。钱学森、汪德昭、李德伦、李惠年等三百多位校友参加活动。

　　林砺儒在北京师大附中60周年校庆时的讲话

　　1962年成立“校务委员会”，邀请部分资深老教师参加，共同研究教育教学重大问题。

　　1963年中央教育部在天津召开北京、天津部分中学办学经验座谈会，刘超代表学校参加，并在会上作了《师大附中办学历史情况和教学经验》的发言。

　　王光美代表刘少奇把印尼总统苏加诺所赠的印尼民族乐器“昂格隆”一套，送给附中青少年。

　　全国中学生运动会上（青岛），我校学生徐永健打破青少年800米全国纪录。徐永健与梁宣虎、章文秀又获四项亚军。

　　1964年师大党委同意附中成立“政治处”，负责全校师生政治思想工作。

　　制定教育教学计划方案，叫做“奔向一个目标、实现两项要求、采取六项措施、执行三条纪律、作好两个安排。”

　　全校师生到卢沟桥农场参加秋收劳动，同时进行“思想革命化”学习，落实搞好教学与学习。

　　高三学生甄小英被树立为“为革命刻苦学习”的典型，其事迹编入少儿出版社出版的《为革命而学》一书。

　　我校一百多名少先队员参加大型音乐舞蹈史诗《东方红》的演出。

　　1965年党支部组织五次教职工学习毛主席著作总结汇报会，推动全校教学工作。

　　刘超校长率领教务主任、教研组长等九人，到上海、南京学习。回校后作出“因材施教、大力改进教学方法”的|决定。

　　1966年为全面提高学生的素质能力，争取高三毕业时达到大学一、二年级水平，采取了生动活泼教学的一系列措施，提出了“坚定、顽强、踏实，深入地掀起一个新的学习高'潮”的口号。

　　“文化大革命”开始。团中央派出的工作组进校，宣布“师大附中是四类学校”，全校师生“停课闹革命”。

　　“文化大革命”期间的师大附中

　　1967年2月，军训团进驻学校，开始“复课闹革命”。

　　l6月，军宣队进入学校，成立“革命委员会”。

　　1968年7月，工宣队进入学校，开始“清理阶级队伍”。

　　8月，在昌平县东二旗大队租沙荒地300亩，修建学农基地一一“师大附中26农场”。

　　1969年经过整党，党组织恢复。

　　1972年师大附中由师大领导，划归宣武区教育局领导，改名为“北京市南新华街中学”。

　　1975年校办工厂生产的“频敏电阻器”，纳入国家计划，远销国外，年产值逾百万元。

　　1976年“文化大革命”结束。恢复、整顿学校各项规章制度，施行“三处、两组”管理体制（教务处、教导处、总务处和教研组、年级组）。

　　1977年8月，北京市委批准恢复原校名：“北京师范大学附属中学”。

　　1978年北京市委决定：师大附中仍归北京师范大学领导。为北京市重点中学之一。撤消革委会，恢复校长制。

　　。

　　1980年改建校舍。兴建教学大楼、实验楼、礼堂、食堂、大操场、学生宿舍楼、教师宿舍楼。

　　1981年11月2日，庆祝建校80周年。

　　1984年高二（2）班被命名为第三届黄继光班。黄继光生前所在连队指导员专程由湖南来京参加命名大会。

　　1985年试行校长负责制、教师聘任制、结构工资制。

　　我校被北京市评为“教育系统先进单位”“花园式学校”。被团中央评为课外活动先进学校，并奖给“活跃的中学生活动”奖旗。

　　高二（2）班被命名为“雷锋班”，雷锋生前所在连队指导员参加命名大会。

　　1986年第一届教职工代表大会召开，通过教代会章程。

　　师大附中学生业余党校正式成立。

　　师大附中高一新生正式开始每年赴石家庄陆军学院进行军训。

　　日本JVC公司与我校合作译制汉语的物理、化学、生物、地理高密度教学视盘（VHD），并赠送播放机。

　　庆祝建校85周年。1936届校友赵泽华倡议建立“校友基金会”，她率先捐出自己的积蓄2700元人民币。

　　1987年校园内建立革命先烈赵世炎塑像。邓小平同志亲笔题字“赵世炎烈士像”。国家领导人杨尚昆、李鹏，北京市委书记李锡铭等参加揭幕式。

　　《北京师大附中三年教改方案》制定。

　　《学生日常行为规范》制定。

　　1988年第二届教代会召开，总结近年教改实验成果。

　　师大附中与日本文化女子大学附属杉并高等学校签订友好协议书。

　　初二（1）班被命名为“赵世炎”班。

　　设立叔苹奖学金，用于奖励学习成绩优异且家庭经济有困难的学生。

　　1990年制定：校长职责、教务主任职责、教研组长职责、班主任工作条例、各处室工作条例等。

　　设立：校友奖学金、奖励在国家、市、区各学科竞赛中获奖的特长学生。

　　师大附中校友会成立。通过校友会章程。

　　师大附中校友基金会正式成立。基金约10万元，全部由海内外校友捐助。

　　1991年师大附中与日本岩手女子高等学校签订友好交流协定。

　　庆祝建校90周年。李鹏总理为学校题词：“发扬师大附中优良传统。”恢复出版校刊。正式出版90年来校友名录、通讯录。

　　1992年北京师范大学批准我校与大兴县教育局签订协议，在大兴县黄村建立师大附中分校，期约8年。

　　1993年日本友人山岸义一捐资一亿日元修建“中日友好研修楼”竣工。在此成立“教育教学研究中心”。

　　我校共青团组织被团市委命名为“北京市红旗团委”。

　　1994年宣武区政府确定我校为“宣武区爱国主义教育基地”。

　　1995年为纪念一二?九运动60周年，当年参加一二?九运动的老校友23人回母校隆重举行纪念会。

　　1996年北京市教工委决定在全市教育系统中展开向我校优秀教师、全国劳动模范、“五一奖章”获得者、优秀共产党员标兵张明珠同志学习的活动。

　　开始举办在职教师研究生课程班，每期2年，第一期学员15人。使教师陆续达到硕士生水平。

　　我校被评为“北京市绿化先进单位”。

　　我校被评为市“首都文明单位”。

　　11月2日，庆祝建校95周年。在人民大会堂隆重举行庆祝大会。六千多位校友参加。彭?云、王光英、雷洁琼参加大会。

　　北京师大附中95周年校庆

　　江泽民主席为校庆题词：“育才兴国。”李鹏、李岚清、彭?云、温家宝、李铁映、吴学谦等领导人也为附中题词。

　　江泽民主席为北京师大附中95周年校庆题词

　　李岚清副总理为北京师大附中95周年校庆题词

　　在教学楼大厅举行林砺儒校长塑像揭幕式，老校友汪德昭、张岱年讲话。

　　出版教学经验汇编――《教海扬帆》；校友回忆文集《树高千尺颂根深》；纪念画册等。

　　1997年被评为市“首都文明单位标兵”。

　　参加在天安门广场举行的首都人民迎接香港回归祖国的庆祝活动。

　　设立吕学礼奖教金，奖励在理科教学上有突出贡献的教师。

　　1998年全校师生为抗洪救灾捐款十四万三千余元及大批衣物。

　　设立罗漾明奖学金、张维、陆士嘉奖教金。

　　1999年4月，第三届校友理事会成立，百年校庆筹备工作正式开始。

　　10月，全校千余师生参加庆祝建国五十周年活动，受到市国庆指挥部的表彰。

　　11月，在宣武区支持下，为争取成为北京市示范性高中校，提出了今后发展的整体规划。